Di solito, puoi interrompere il funzionamento del avvio del disco andando su Preferenze di Sistema > Risparmio energetico, quindi deselezionare "Metti in pausa gli hard disk quando possibile". Tuttavia, mentre questo è certamente vero per il disco di avvio, se questo viene rispettato da unità esterne sembra essere interamente dipendente dall'unità stessa.
Questa pagina contiene ulteriori informazioni, inclusa una descrizione del problema, ma dice anche
Second, some non-startup drives simply ignore the setting of Put the hard disk(s) to sleep when possible and spin down on their own schedule. This appears to be a function of either the drive itself or, in the case of external drives, the firmware or chipset employed in the drive's enclosure. In such a case the drive's Standby behavior cannot be changed. One can contact the manufacturer of the drive or enclosure to see if a firmware update is available to improve its cooperation with Mac OS X power management.
L'unico altro modo in cui riesco a pensare a questo problema, se il precedente non funziona, è mantenere forzatamente l'unità sveglia. Per fare ciò, puoi semplicemente impostare uno script su touch un file sull'unità esterna a intervalli fissi.