Questo sembrerà stupido, ma hai riavviato il Mac? Ho avuto questo problema sul mio Magic Trackpad un paio di volte e l'unico modo in cui ero in grado di curarlo era con un semplice riavvio. (All'inizio ho pensato che potesse essere perché ho eseguito anche MagicPrefs, ma da allora l'ho rimosso e il problema si verifica ancora a volte).
Se trovi che il riavvio lo "corregge", come ho fatto in passato, allora è possibile che il software si confonda piuttosto che un problema fisico. Non ho ancora trovato un'invocazione del Terminale per riavviare la parte del driver del mouse del Mac, ma penso che se ne trovassi uno probabilmente potrei usarlo per staccare il pad quando si presenterà il problema.