Facendo clic con il pulsante destro del mouse sull'icona dell'Application Dock, evidenzia le opzioni e deseleziona "Keep in Dock". Dovrai farlo per tutte le applicazioni nel Dock.
Se desideri avere SOLO applicazioni aperte nel Dock, ecco un comando Terminal.app che puoi eseguire per modificare le preferenze per mostrare solo le applicazioni aperte nel Dock.
defaults write com.apple.dock static-only -bool TRUE; killall Dock
per tornare alla normalità, sostituire TRUE con FALSE in questo modo ..
defaults write com.apple.dock static-only -bool FALSE; killall Dock
Apri semplicemente terminal.app nelle tue applicazioni, copia e incolla. Ciò resetterà Finder anche io credo, quindi completa prima eventuali download e qualsiasi copia di file o spostamento per evitare interruzioni.
Ho dimenticato di aggiungere: non ho familiarità con quel programma specifico, ma sembra anche che tu abbia un programma malware. Suggerisco di cancellare completamente l'applicazione.
Modifica: con le pochissime informazioni fornite, penso che non tutti i processi siano mostrati nel monitor delle attività. Di default vengono mostrati solo i processi dell'utente. Quelli di root user non lo sono. Se quei processi della GUI eseguiti da root sono molto pericolosi e poiché sul dock sono presenti più copie, è necessario disporre di più copie dell'applicazione sui file, non so in alcun modo che vengano visualizzate più icone dock della stessa applicazione. Questa applicazione sembra agire senza controllo, motivo per cui ho affermato che potrebbe essere un malware. Meglio cancellare in modo sicuro tutti i file per l'applicazione e reinstallare correttamente una nuova copia per fermare i problemi.