Il carattere tilde è una scorciatoia per la directory home dell'utente attualmente loggato (in sistemi operativi simili a UNIX).
Anche nei percorsi delle directory di iCloud è incluso.
Ad esempio:
com~apple~CloudDocs
o
com~apple~mail
Che significato ha?
E in generale: Qual è la ragione di questi strani percorsi di file?
Il motivo per nominare cose come quelle che iniziano con il dominio di primo livello e diventare sempre più specifiche è quello di raggrupparle automaticamente al momento della loro quotazione. Questa è una pratica comune per cose come le classi java o i file delle preferenze (ma solitamente separati da punti).
L'uso del carattere tilde non ha nulla a che fare con la tilde della home directory. Immagino che sia solo uno degli ultimi simboli rimanenti del set di caratteri standard senza un significato speciale in questo contesto, mentre .:;<>$/"*# e così via potrebbero avere conflitti con diverse interpretazioni.