Hai collegato unità esterne? Alcuni dischi rigidi esterni entrano in una sorta di modalità dormiente quando non sono stati utilizzati per un po 'di tempo e bloccheranno le cose fino a quando non torneranno indietro. Ciò è innescato da qualsiasi cosa richieda l'accesso al filesystem, indipendentemente dal fatto che tu stia cercando di accedere a tali unità o meno.
Se questo è il tuo problema, sarà molto intermittente e causato da altri tentativi di accesso al file system (le finestre di dialogo Apri file e Salva file sono comuni). Inoltre, non si limiterà solo a Textmate, ma i tuoi pattern di utilizzo potrebbero significare che per lo più si presenta lì.
La soluzione, in questo caso, sarebbe quella di scollegare le unità esterne quando non sono in uso.
Ovviamente, questo non vuol dire questo / è / il tuo problema, ma sarebbe più o meno corretto per i tuoi sintomi.