Puoi farlo con la GUI di Growl, non l'approccio migliore, ma dovrebbe funzionare:
Con la GUI sviluppata è possibile impostare la durata dell'evento per stile. Puoi anche assegnare stili per applicazione.
Quindi, se assegni stili diversi a diverse applicazioni, puoi ottenere l'effetto desiderato. Ma ciò si tradurrebbe in diversi stili visivi per diverse applicazioni, che potrebbero non essere desiderati. Potresti anche essere in grado di duplicare stili (non so come) e assegnare stili che siano gli stessi visivamente a diverse applicazioni. In alternativa potresti essere in grado di creare nuovi stili basati su quelli esistenti.
Ancora una volta, non è la soluzione migliore, ma dovrebbe funzionare.