Ho avuto lo stesso problema, con alcune volte al giorno, ma solo quando invio email. La ricostruzione della casella di posta non ha aiutato.
Alla fine ho scoperto che stavo memorizzando bozze di messaggi sul server. Selezionato in Mail > Preferenze > someemailaccount > Comportamenti delle cassette postali > Casella postale bozze .
L'ho modificato in un'impostazione locale "Sul mio Mac". Non ho avuto un singolo errore oggi e ieri da quando lo faccio!
Penso che quello che stava succedendo era che il mio provider di posta stava inviando il messaggio e cancellando il messaggio dalle bozze, nel frattempo, Apple Mail voleva eliminare il messaggio dalle bozze, e, si sono scontrati a seconda di che è successo prima