Senza conoscere ulteriori dettagli, non posso saperlo con certezza, ma sembra probabile che la moglie di tuo padre stia ricevendo i messaggi inviati a lui, ma non i messaggi di testo SMS. Questo è il comportamento progettato: i messaggi vengono inviati a un ID Apple e, se condividono un ID Apple, iMessage andranno a entrambi. La soluzione è per loro non condividere un ID Apple.
Detto questo, è possibile impostare un diverso ID Apple per i messaggi, mantenendo lo stesso ID Apple per l'app store, iTunes, ecc. Ciò consentirebbe loro di condividere gli acquisti, ma di tenere separati i loro messaggi l'uno dall'altro.
Puoi anche andare in Impostazioni > Messaggi > Invia & Ricevi e deseleziona segna l'indirizzo email associato a entrambi i loro telefoni (e ID Apple). C'è una buona possibilità che risolverà anche il tuo problema.