In breve; no non c'è un modo semplice per aggiornarli. (Supponendo che la compilazione da sorgente non sia considerata facile)
Vorrei assolutamente evitare di modificare le versioni installate del sistema poiché è probabile che le versioni aggiornate vengano interrotte quando Apple emette un aggiornamento che le aggiorna. (Di solito aggiorna la sicurezza e ha morso alcuni utenti / amministratori di sistema quando Perl è stato aggiornato)
Se si desidera aggiornarli è necessario scaricare i file di origine e installarli sopra le versioni fornite.
Come alternativa ragionevole, ti consiglio di installare la tua versione gestita di PHP e MySQL in /usr/local
o di utilizzare il software di packaging prescelto (MacPorts, Fink o Homebrew) o l'installer preparato (ad esempio il programma di installazione .pkg di MySQL che installa in /usr/local
).