Potresti forse provare a disabilitare la protezione dell'integrità del sistema fornita con El Captain. Se vuoi farlo (a tuo rischio e pericolo) vedi Disabilita l'integrità del sistema Protezione (senza radici) .
In realtà è ciò che dicono sul link che hai fornito:
I believe this is from changes related to the new “rootless” or System Integrity Protection feature of El Capitan (more info). Whether it’s a bug or a feature is impossible to tell at this point. If it’s a bug, then that means Apple should be fixing it in a future point release, for example 10.11.1. If it’s a feature, they need to update their bless tool and remove the featureset entirely.
Il rootless o System Integrity Protection è progettato per impedire all'app di modificare i file relativi al sistema. Il modo in cui BootChamp funziona è che usa il comando bless
per cambiare il disco di avvio corrente. Questo non funziona più con rootless abilitato. Altri software come Refind non funzionano più grazie a rootless. System Integrity Protection è lì per evitare che le applicazioni danneggino il tuo computer. È relativamente sicuro disabilitarlo, ma assicurati di sapere quali app vengono eseguite sul tuo Mac.