Posso dirti, questo è piuttosto difficile da fare da soli.
Se stai cercando di sostituire le icone di sistema, come le cartelle, sono qui:
/System/Library/CoreServices/CoreTypes.bundle/Contents/Resources/
Se vuoi sostituire le icone per le app sotto / Applicazioni, devi farlo singolarmente. Tipicamente:
/Applications/AppName.app/Contents/Resources/AppName.icns
Dopo averlo sostituito, la nuova icona non verrà visualizzata fino a quando la cache dell'icona non verrà ripristinata. In Mavericks, la reimpostazione di LaunchServices aggiornava l'icona, ma in Yosemite, dal momento in cui l'ho utilizzata, "iconcache" deve essere cancellato.
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Tutto sommato, ci vuole pazienza.