Il problema è che, se si nasconde (ALT-clic o CMD-H), si nascondono le tutte finestre di quell'applicazione. Probabilmente non vuoi farlo, solo per ridurre al minimo la finestra corrente.
In OS X non hai la barra del titolo, con un elemento per ogni finestra aperta (ad esempio 3 elementi diversi per 3 finestre di MS Word) - ma invece, un indicatore per le applicazioni che hanno finestre aperte, ma nulla indica quante finestre sono aperte ... quindi non sai in realtà dove fare clic nel Dock per minimizzare quale finestra esatta (se sono aperte più finestre della stessa app). Puoi fare clic con il tasto destro del mouse sull'app nel Dock, quindi otterrai l'elenco delle finestre aperte, ma questo è per le persone che hanno molto tempo da perdere cliccando. Per i praticanti Zen: -)
Alcuni comportamenti simili a Windows possono essere ottenuti con strumenti di terze parti come HyperDock, ma non ricordo che ho avuto modo di fare clic su una finestra per ridurla al minimo. Ma sinceramente l'ho provato per un tempo molto breve.