Non hai specificato, quindi presumo che tu stia utilizzando Windows. Il consiglio qui si applica a tutti i sistemi operativi, ma i dettagli specifici variano in qualche modo.
Skype, come un numero enorme di altre app, siti e servizi, utilizza sessioni di accesso di lunga durata che sono memorizzate nel tuo account utente. A meno che un utente malintenzionato sia in grado di sedersi davanti a una sessione di accesso sul computer o di eseguire software dannoso nel proprio account utente o come amministratore, tali sessioni sono sicure. Un altro utente sullo stesso computer non avrebbe accesso alle sessioni (a meno che non siano esse stesse un amministratore, e forse nemmeno in quel momento, a seconda del modo in cui le sessioni vengono archiviate e se entrambi sono stati entrambi registrati contemporaneamente); se lanciassero Skype, gli chiederebbero una password (se non l'avevano già usato su quell'account computer precedente) o riprenderanno la propria sessione.
Se sei preoccupato che qualcun altro abbia accesso a tali account, la prima linea di difesa impedisce l'accesso fisico al tuo computer da parte di persone che non ti fidano. La sicurezza fisica è per lo più fuori portata per Security.SE, quindi mi limiterò a menzionare che, se il computer è in qualche modo portatile e si è preoccupati che possa essere rubato (o il suo disco rigido), cerca di usare la crittografia a volume pieno ( come la funzionalità BitLocker di Windows) in modo che il ladro non sia in grado di recuperare alcun dato.
La prossima (e spesso la più importante) linea di difesa è il tuo account utente sul computer. Assicurati che abbia una password sicura e cambia quella password se ti aspetti che qualcuno di cui non ti fidi possa averlo visto. Non fare sciocchezze come metterlo su una nota appiccicosa nel tuo ufficio o utilizzare un suggerimento per password davvero ovvio (o qualsiasi suggerimento). Assicurati che il computer sia impostato per bloccare la sessione dopo alcuni minuti di inattività - 10 in generale va bene - e quando riprendi dal sonno e bloccalo da solo quando ti alzi per uscire dalla stanza, c'è la possibilità che qualcun altro possa prendere il possibilità di usarlo (la scorciatoia per bloccare la sessione è WinKey + L, oppure puoi usare Start o Ctrl + Alt + Canc e selezionare Lock). Se la tua macchina è dotata di Bluetooth, puoi anche accoppiare il telefono al computer e configurare la macchina in modo che si blocchi automaticamente quando il tuo telefono esce dalla portata (che si trova a circa 30 metri di distanza).
Se condividi il computer (con persone di cui non ti fidi completamente), la cosa più importante da fare è assicurarsi che tutti gli altri utilizzino un account utente diverso da quello che fai (potrebbero ciascuno avere il proprio, o potrebbero tutti usano un account ospite singolo, o da qualche parte in mezzo). Assicurati che nessuna delle persone non del tutto fidate abbia un account a livello di amministratore (in effetti, dai loro il minimo privilegio possibile). In una situazione come questa, obbliga in particolare a bloccare sempre il computer (o uscire dalla sessione) quando cambi utenti. La funzione "switch user" di Windows blocca automaticamente la sessione.)