Sebbene i file PDF con Javascript possano essere utilizzati con gli attacchi, ci sono anche motivi legittimi per avere un file PDF in esso, ad esempio per convalidare l'input nei moduli PDF.
Per questo motivo è impossibile dire cosa fare basandosi solo sul fatto che un PDF conteneva Javascript. Invece è necessario controllare da dove provengono questi file, chi è il destinatario, se il destinatario si aspetta che tali file siano, se la fonte è nota per i file PDF che contengono Javascript per un motivo non dannoso ecc.