EFS utilizza Alternative Data Streams (ADS), una funzionalità NTFS che alcuni driver di file system di terze parti hanno per il supporto poco o per nulla. Anche se il driver supporta ADS, non garantisce che supporti anche EFS, soprattutto perché ciò richiederebbe un posto dove inserire la chiave dell'utente. Ogni file EFS è crittografato con una chiave univoca e tale chiave è a sua volta crittografata ("wrapped") con le chiavi utente di ogni utente che ha accesso al file e quelle chiavi avvolte sono memorizzate in ADS del file; il certificato EFS di cui è stato eseguito il backup contiene la chiave utente necessaria per scartare le chiavi del file.
In teoria, non c'è motivo per cui non si possa usare un'app iOS per decodificare i file EFS. Innanzitutto, l'app deve essere in grado di accedere al disco rigido in questione (che non è un supporto di memorizzazione a cui i dispositivi iOS solitamente si connettono). Quindi sarebbe necessario sapere come accedere a ADS, come leggere i metadati EFS e come importare la chiave utente (in più è necessario fornire la chiave e la relativa password). Da lì, tuttavia, EFS utilizza una suite di crittografia crittografica ben nota (e in qualche modo obsoleta da questo punto); un'app per iOS non avrebbe problemi a gestirlo.
Non so se sia mai stata scritta un'app con queste funzionalità. Sembra improbabile; iOS non è un sistema operativo costruito per questo tipo di lavoro. C'è qualche ragione per cui non puoi semplicemente usare una macchina Windows (o, meglio ancora, Linux) per decifrare i file? Su Windows sarebbe facile (basta re-importare il certificato e la chiave utente), e su Linux sono sicuro che potresti trovare un'utilità per gestire i file EFS.