Non sono solo i dati a cui dobbiamo pensare, ma anche il file system e i metadati associati ai file e al file system.
Se ( un grande IF ) possiamo determinare con certezza che BitLocker abbia crittografato solo lo spazio libero finora (saltando tutto il resto), quindi la domanda che hai posto diventa almeno una possibilità teorica (ancora dipende da come viene scritto il codice BitLocker - se rileva le modifiche al disco dopo l'avvio della crittografia e come gestisce tali modifiche).
In generale, i dati del file system non vengono solo memorizzati all'inizio, ma anche alcune copie ridondanti vengono archiviate in altri luoghi.
Dobbiamo supporre che BitLocker abbia già crittografato tali metadati - e qualsiasi modifica apportata al file system (come l'eliminazione di file) modifica i dati già crittografati (inclusi blocchi liberi, numero di file, directory, ecc.).
Quindi la mia risposta è NO. Stai molto meglio fermando del tutto la crittografia; fare qualsiasi cosa che si desidera fare e poi ricominciare da capo.