Hai ragione a pensare che queste tre tecnologie siano complementari e spesso rilevano gli stessi problemi. Tuttavia, questo di per sé non è un motivo per non usarli a strati. Uno può prendere cose che l'altro non può. Guarda scanner di virus - ecco un esempio in cui solo 14 % dei 37 scanner tentati hanno trovato il virus ! E questo ha lo stesso identico tipo di protezione!
I prodotti che hai elencato hanno più varianti rispetto al confronto con gli scanner di virus e in effetti presentano differenze architettoniche significative. Un HIDS vedrà spesso cose che superano il NIDS a causa della crittografia SSL. Un WAF avrà spesso firme specifiche per un'applicazione web che NIDS e HIDS non avranno. Il NIDS rileverà attacchi a livello di rete che WAF e HIDS non noterebbero mai.
In breve, complementare non significa uguale.