I nomi delle opzioni non fanno parte del protocollo SSH; sono specifici per una determinata implementazione. Suppongo tu stia parlando di  OpenSSH . 
 Come da  documentazione : 
RSAAuthentication
    Specifies whether pure RSA authentication is allowed. The default is
    “yes”. This option applies to protocol version 1 only.
 Quindi questo non si applica al tuo caso, dal momento che si desidera utilizzare ECDSA e le chiavi ECDSA sono supportate solo con la versione 2 del protocollo SSH. 
 Se i client possono autenticarsi con le chiavi (anziché, ad esempio, le password) è impostato con l'opzione  PubkeyAuthentication . Tuttavia, i tipi di chiave consentiti non sembrano configurabili. Una chiave client verrà accettata se corrisponde alla chiave pubblica memorizzata nel file   .ssh/authorized_keys    dell'account di destinazione; quindi, se si desidera limitare l'autenticazione della chiave a ECDSA, è necessario disporre che solo le chiavi pubbliche ECDSA vengano visualizzate in tali file.