In questo ordine di grandezza (1000 password), non vedo nessun lato negativo da un punto di vista della sicurezza. Se mai, direi che è una buona idea. Certo, ridurrete il pool di possibili password che, in teoria, riducono la sicurezza. In pratica, tuttavia, quelle password più comunemente utilizzate saranno una delle prime parole che un utente malintenzionato proverà.
In effetti, ho visto alcuni servizi Web che lo rivelavano nei loro moduli di registrazione. Alcuni addirittura bloccano interi dizionari oltre alle password comuni.