Uso l'ultimo OS X El Captain su MacBook Pro Retina, e ho avuto questo problema da Yosemite.
Quando provo a selezionare un file da caricare nel browser (lo stesso problema in Safari e Chrome, ma non in altre applicazioni come Photoshop) - Nasconde tutte le cartelle quando faccio clic su qualsiasi tag colorato sul pannello laterale. Le cartelle scompaiono subito dopo mezzo secondo. Pertanto, sono in grado di selezionare un file con tag, ma non posso accedere alla cartella con tag e selezionare un file lì.
Ho provato a eliminare com.apple.finder.plist, ho anche provato a creare un nuovo utente, ma il problema rimane: (