Con ogni probabilità, sì. Non l'ho provato con esattezza, ma se Time Machine rileva dei file mancanti, potrebbe incorrere in qualche problema o dover eseguire nuovamente il backup di una porzione significativa. Parte del versioning di Time Machine fa affidamento su un sacco di file, quindi quando le versioni precedenti si aspetta di vedere in giro non ci sono, potrebbero accadere cose brutte. È un sistema un po 'opaco, quindi è difficile dirlo con certezza, ma è meglio non muckare con i backup.
Se vuoi una certa ridondanza (che è sicuramente una buona idea per il tuo sistema di backup), ti suggerirei una delle due opzioni. Il primo consiste semplicemente nel configurare due condivisioni netatalk come destinazioni di Time Machine. OS X è in grado di gestire diversi dischi di Time Machine, quindi puoi sfruttare questa funzionalità. Ruota periodicamente la condivisione online.
La seconda opzione consiste nel clonare il disco di backup sul server. Probabilmente vorresti fare una specie di controllo per assicurarti che non venga scritto attivamente, ma dovresti essere in grado di fare un semplice rsync dei dati (assicurandoti che ci siano le opzioni giuste per preservare Respondi risorse , ecc.) e disporre di una seconda copia del backup.