Ho un MacBook Pro con l'ultima versione di Yosemite e la versione più aggiornata di iTunes.
All'apertura di iTunes mostra che ho 6 canzoni, ho provato a eliminare questi brani più volte facendo clic con il pulsante destro del mouse, premendo "Mostra nel Finder" e spostandoli nel cestino, ma non scompariranno da iTunes, non importa quello che faccio. Ho persino rimosso la cartella delle cache ma senza fortuna anche dopo il riavvio.
Rimuovendoli dal tuo disco rigido non ha alcun peso se vengono visualizzati su iTunes. Devi effettivamente rimuoverli anche da iTunes. (Fai clic con il pulsante destro del mouse > Elimina o modifica il menu > Elimina mentre il brano è evidenziato) La (quasi) unica volta che iTunes sa se un file nella libreria di iTunes esiste effettivamente sul disco rigido è quando tenti di riprodurlo.
Inoltre, se utilizzi il metodo sopra, offrirà di rimuovere la canzone dal tuo disco rigido nello stesso momento in cui la rimuoverà da iTunes.