Se chiudi la finestra e con la X rossa, questa viene chiusa. Se minimizzi la finestra, dovrebbe aprirla. Quindi prova a ridurlo al minimo. Inoltre, quando si chiude la finestra e l'applicazione è ancora in esecuzione, a volte c'è una scelta rapida da tastiera per riaprire la finestra. Ricorda che devi essere "focalizzato" sull'applicazione per poter eseguire scorciatoie da tastiera che influenzano tale applicazione. Per vedere quale applicazione stai "focalizzando" è mostrata nell'angolo in alto a sinistra dello schermo.
EDIT: Ho provato questo con il mailosapp integrato di OS X Yosemite e sono stato in grado di riaprire la finestra dell'applicazione premendo la combinazione di tasti Alt + Cmd + N quando sono passato ad esso tramite Cmd + Tab. Questo è stato testato su Yosemite, ricorda che potrebbe differire dalle altre versioni di Mac OS X.