Installazione di pymol usando macports su yosemite

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Ho provato a installare pymol usando macports (dopo aver tentato di creare dal codice sorgente fallito): 

sudo port install pymol

L'ha installato, dandomi due avvertimenti: 

Warning: xcodebuild exists but failed to execute
Warning: Xcode does not appear to be installed; most ports will likely fail to build.

Sono in grado di eseguire pymol, ma si blocca dopo circa un minuto. Inoltre, la finestra in alto non mostra alcun pulsante:

Ilmessaggiodierroreè:

Questo a causa degli avvertimenti che port mi ha dato all'inizio, o c'è qualcos'altro al lavoro qui?

    
posta sodiumnitrate 05.03.2015 - 01:32
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2 risposte

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Nel caso in cui questo aiuti qualcuno, questo lo farà compilare e caricare.

Primo Disinstalla Pymol

Quindi: 

% sudo port install tcl -corefoundation
% sudo port install tk -quartz
% sudo port install pymol

Questo è descritto qui:

link

    
risposta data 23.06.2015 - 02:29
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La mia ipotesi è che qualcos'altro sia al lavoro.

Gli avvertimenti sono che non hai installato Xcode (cioè gli strumenti di sviluppo). Molti pacchetti MacPorts richiedono la compilazione, quindi è necessario l'ambiente di compilazione.

Sarebbe davvero di grande aiuto avere la finestra di crash completa, perché ci sono molti messaggi utili per gli sviluppatori.

Quello che segue è una speculazione completa da parte di qualcuno che sviluppa codice open source misto Python e C / C ++, proprio come PyMol.

La mia ipotesi è che una parte del codice PyMol stia collegando una libreria diversa che è stata modificata con l'aggiornamento di Yosemite.

Quando ho installato più versioni di Python, a volte può essere difficile assicurarsi che il codice stia utilizzando la versione corretta delle librerie. Questo è particolarmente vero per tutte le versioni del sistema operativo, dal momento che molte librerie sono aggiornate da Apple.

    
risposta data 05.03.2015 - 03:17
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