Come eliminare tutti i file in una cartella uguali a quelli di un'altra cartella

Ho due cartelle contenenti video: la prima contiene video che sono già referenziati all'interno di Aperture e la seconda contiene un mix di duplicati e video che NON sono già in Aperture. Quello che mi piacerebbe fare è che la seconda cartella contenga SOLO file che non sono già in Aperture (in modo che io possa aggiungerli). Come posso eliminare in modo relativamente semplice i file duplicati nella seconda cartella? Ho giocato con DeltaWalker di Deltopia, ma non sembra in grado di permettermi di eliminare facilmente i file duplicati.