No, non è pericoloso. Praticamente ogni singola attività viene accodata e mantenuta se necessario. A meno che tu non abbia un'attività in primo piano con un bel pulsante "x" per fermarlo, puoi riavviare, spegnere, dormire, ecc. Senza problemi. Le attività di sistema in OS X sono progettate per essere completamente automatiche, autonome e fuori mano per l'utente.
Una volta completato, potresti ricevere un altro messaggio dal centro notifiche, ma probabilmente sarà fatto solo in silenzio e il tuo sistema 'si sentirà' molto più veloce.
La maggior parte delle ottimizzazioni post-installazione sono cose come l'indicizzazione di Spotlight e LSServices che fa la cosa.
Se vuoi vedere se il tuo sistema sta facendo qualcosa in background, puoi aprire il monitor delle attività e lasciarlo inattivo per un po 'in modo che OS X rilevi che non stai facendo nulla e poi morde un po' di più CPU potenza e memoria per svolgere compiti di sistema finché non entri e ricominci a fare le cose. Probabilmente vedrai processi come "mds" che utilizzano una porzione significativa del tuo tempo di CPU. Fa parte dei riflettori e raccoglie informazioni su dove tutto è così puoi utilizzare la funzione di ricerca per trovare le tue cose.