com.apple.bkagentservice fa parte di BookKit, che a sua volta fa parte di iBooks.
Sulla base delle informazioni limitate nella tua domanda, suppongo che BKAgentService stia cercando di riconciliare i tuoi libri in iBooks.app sul tuo Macbook con i libri registrati sul tuo account in iCloud, e alcuni conflitti lo fanno andare un po ' mentale.
Qualcosa che proverei è chiudere iBooks, uccidere BKAgentService, rinominare le seguenti due cartelle e riaprire iBook. Questo riavvierà BKAgentService e dovrebbe iniziare a sincronizzare la libreria da zero.
/Users/YOURUSERNAME/Library/Containers/com.apple.iBooksX
/Users/YOURUSERNAME/Library/Containers/com.apple.BKAgentService